Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms