Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCAF13Q9NV06 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms