Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms