Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms