Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms