Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GLB2Q9NR46 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms