Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C8orf4Q9NR00 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms