Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 519.23■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 211.3
UTP3Q9NQZ2 RPS7-209ENST00000491937 987 ntTSL 227.78■■■□□ 2.042e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)27.78■■■□□ 2.042e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 ARF3-205ENST00000536283 537 ntTSL 423.55■■□□□ 1.361e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 522.19■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 MAU2-216ENST00000609122 551 ntTSL 421.55■■□□□ 1.041e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 PDLIM1-202ENST00000477757 850 ntTSL 221.41■■□□□ 1.021e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 MAU2-214ENST00000592069 558 ntTSL 419.33■□□□□ 0.681e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.371e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 MAU2-205ENST00000586189 590 ntTSL 516.52■□□□□ 0.241e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RELT-207ENST00000545886 4346 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 PDIA5-202ENST00000467157 2232 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RELT-204ENST00000539134 3244 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 SNX14-219ENST00000515216 3288 ntTSL 510.76□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 LDB1-203ENST00000461873 478 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-8■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 PDIA5-203ENST00000469649 722 ntTSL 57.61□□□□□ -1.191e-24■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 ADGRV1-218ENST00000639473 6608 ntTSL 57.57□□□□□ -1.25e-10■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 DLEU1-216ENST00000473075 348 ntTSL 55.24□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 ADGRV1-232ENST00000640403 6723 ntTSL 54.56□□□□□ -1.685e-10■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 IQGAP2-209ENST00000505766 4255 ntTSL 24.43□□□□□ -1.78e-7■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.748e-7■■■■■ 211.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-212ENST00000433533 471 ntTSL 36.59□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 210.9
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-228ENST00000486224 526 ntTSL 36.29□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 210.9
UTP3Q9NQZ2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 210.8
UTP3Q9NQZ2 USP7-215ENST00000566273 577 ntTSL 412.39□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 210.8
UTP3Q9NQZ2 USP7-219ENST00000569230 569 ntTSL 55.69□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 210.8
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)23.79■■□□□ 1.46e-7■■■■■ 210.7
UTP3Q9NQZ2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 210.4
UTP3Q9NQZ2 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 210.4
UTP3Q9NQZ2 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 210.4
UTP3Q9NQZ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 523.38■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF6-218ENST00000523378 949 ntTSL 317.81■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 210.1
UTP3Q9NQZ2 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 219.21■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 209.8
UTP3Q9NQZ2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 209.8
UTP3Q9NQZ2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 209.8
UTP3Q9NQZ2 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 515.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 209.8
UTP3Q9NQZ2 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 209.8
UTP3Q9NQZ2 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 209.8
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-207ENST00000492757 548 ntTSL 322.68■■□□□ 1.223e-9■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-212ENST00000512902 533 ntTSL 317.84■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-214ENST00000515024 557 ntTSL 317.31■□□□□ 0.362e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-213ENST00000592732 795 ntTSL 316.19■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 02e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-207ENST00000589438 1033 ntTSL 314.51□□□□□ -0.092e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-210ENST00000590808 777 ntTSL 514.38□□□□□ -0.112e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 FBXL12-209ENST00000590277 581 ntTSL 313.85□□□□□ -0.192e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-209ENST00000509440 543 ntTSL 47.9□□□□□ -1.142e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-208ENST00000508869 467 ntTSL 37.55□□□□□ -1.22e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-207ENST00000508729 549 ntTSL 47.55□□□□□ -1.22e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 TMCC1-206ENST00000505924 665 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-12■■■■■ 209.6
UTP3Q9NQZ2 PHB2-204ENST00000536316 739 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-12■■■■■ 209.3
UTP3Q9NQZ2 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 209.2
UTP3Q9NQZ2 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 209.2
UTP3Q9NQZ2 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 209.2
UTP3Q9NQZ2 MYO18B-210ENST00000543971 1768 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-10■■■■■ 209.1
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.671e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-207ENST00000466521 1878 ntTSL 531.72■■■□□ 2.671e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.661e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-214ENST00000490298 1718 ntTSL 529.1■■■□□ 2.251e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.751e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 MAPK3-209ENST00000478356 961 ntTSL 511.74□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 209
UTP3Q9NQZ2 TMEM131L-201ENST00000240487 4299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 DDX41-202ENST00000503078 2375 ntTSL 226.21■■□□□ 1.793e-7■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 DDX41-201ENST00000330503 2137 ntTSL 1 (best)18.37■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 DDX41-205ENST00000505081 2949 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 BOP1-202ENST00000568812 878 ntTSL 521.57■■□□□ 1.047e-8■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 208.8
UTP3Q9NQZ2 NADK-208ENST00000477235 1004 ntTSL 217.62■□□□□ 0.414e-22■■■■■ 208.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-216ENST00000497747 467 ntTSL 217.56■□□□□ 0.44e-22■■■■■ 208.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-215ENST00000497615 534 ntTSL 216.42■□□□□ 0.224e-22■■■■■ 208.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-214ENST00000497186 683 ntTSL 315.38■□□□□ 0.054e-22■■■■■ 208.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 648.3 ms