Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms