Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms