Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIN28AQ9H9Z2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIN28AQ9H9Z2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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