Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF1DQ9H5J8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms