Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms