Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD1Q9GZZ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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