Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms