Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2J2Q9GZM3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms