Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7BQ9C0I4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD7BQ9C0I4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms