Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMBRA1Q9C0C7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMBRA1Q9C0C7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms