Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNKL1Q9BZJ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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