Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms