Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5DQ9BY66 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms