Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM14BQ9BX40 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms