Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTDSS2Q9BVG9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms