Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA3Q9BTC8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms