Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPOCK3Q9BQ16 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms