Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS3Q99687 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms