Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POP1Q99575 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms