Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PIK3R4Q99570 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3R4Q99570 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms