Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EYA3Q99504 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA3Q99504 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms