Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD1Q99460 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD1Q99460 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms