Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIN3AQ96ST3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIN3AQ96ST3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms