Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms