Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC9Q96Q05 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms