Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
OPALINQ96PE5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OPALINQ96PE5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms