Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms