Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
JSRP1Q96MG2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms