Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms