Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD4Q96M96 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms