Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms