Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms