Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM44Q96DX7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms