Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD4Q96DM1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD4Q96DM1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms