Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4CQ96CF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms