Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYAP1Q96A49 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYAP1Q96A49 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms