Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms