Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRAT1Q92837 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRAT1Q92837 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms