Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms