Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF3Q8TEJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms