Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC148Q8NFR7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms