Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET6

CHST13, Carbohydrate sulfotransferase 13, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST13Q8NET6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHST13Q8NET6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST13Q8NET6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms